Sau khi ướp, trà được ủ trong chum sành, dưới đáy và bên trên đều lót và đậy một lớp lá sen. Sau khoảng hai ngày, trà đã hút hết hương từ gạo, người làm lại sàng gạo ra và đem sấy khô trà, rồi tiếp tục ướp thêm một lần gạo nữa. Quy trình được lặp 5-7 lần.
Tuy nhiên, ngày nay, để phục vụ đa dạng đối tượng khách hàng, người làm trà sen chỉ ướp hai hoặc ba lần. Thành phẩm thường rẻ hơn, do hương thơm bị giảm bớt.
Anh Duyệt cho biết ướp 5-7 lần là đủ, không nên ướp thêm, khiến sen át vị trà.